O CEPEJ é formado por órgãos executivos que são subdivididos em grupos de trabalho (GT’s) e grupos de estudo (GE’s), que instrumentalizam as nossas atividades.

Os GT’s organizam-se de acordo com as atividades temporárias ou permanentes do CEPEJ, e os membros podem participar de quantos desejem, desde que estejam vinculados a, no mínimo, um e, no máximo, três. Os nossos GT’s atuais são: SEMIP, CENEPEJ, Revista do CEPEJ, Quintas Fundamentais, Direito e ciência e Pesquisa. 

Os Grupos de Trabalho serão compostos por, pelo menos, três membros efetivos do CEPEJ, sendo: secretário; um responsável financeiro; um relator.